Caratterizzazione genetica, biochimica e di struttura del germoplasma di pomodoro della regione Puglia nel panorama della biodiversità italiana di pomodoro

L'Italia è un centro secondario di diversità per il pomodoro (Solanum lycopersicum L.), in cui si coltivano numerose popolazioni e varietà locali. Abbiamo esplorato la diversità genetica di una collezione di 55 accessioni di pomodoro pugliesi, utilizzando il Tomato 51K Axiom Single Nucleotide Polymorphism (SNP) genotyping array. Tra queste, vi sono sei accessioni denominate “Pomodoro di Manduria” (PM), i cui frutti sono riconosciuti come produzioni agroalimentari tradizionali (PAT) dal Ministero Italiano dell'Agricoltura e come presìdi dalla Fondazione Slow Food. Sono state inoltre determinate diverse caratteristiche fisico-chimiche (pH, attività antiossidante e contenuto di zuccheri solubili, composti fenolici e nove isoprenoidi individuali, tra cui carotene e licopene) delle salse di pomodoro ottenute da una selezione di 21 accessioni. Cinque delle sei accessioni di PM sono state dichiarate geneticamente identiche in base al parametro della Identità per Stato. In accordo con questo risultato, le caratteristiche fisico-chimiche delle salse di pomodoro ottenute da queste cinque accessioni di PM sono risultate simili, e chiaramente distinte da quelle di salse di pomodoro ottenute da altre accessioni. I dati di polimorfismo delle accessioni pugliesi sono stati infine integrati con dati di risequenziamento genomico disponibili per 35 popolazioni di pomodoro tradizionalmente coltivate in Italia, disponibili presso il database NCBI. Analisi parametriche e non parametriche della struttura genetica hanno indicato, tra l’altro, la differenziazione genetica tra accessioni a frutto grande e a frutto piccolo. Complessivamente, questo studio fornisce informazioni preziose per la conservazione e la valorizzazione dell’agro-biodiversità italiana di pomodoro.