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By screening 104 faecal samples from asymptomatic calves in Italy, bovine norovirus RNA was detected with a prevalence rate of 10.5 % (11/104). A continuous sequence spanning the RdRp region and the 5' end of the capsid gene was generated for 7 of the 11 strains. Upon phylogenetic analysis, five strains were grouped with GIII.2 Newbury2-like viruses, and one strain was grouped with GIII.1 Jena-like noroviruses. Interestingly, one strain (80TE/IT) was genetically related to the GIII.1/Jena/80/De in the RdRp but resembled the GIII.2/Newbury2/76/UK in the capsid gene, suggesting a recombination event occurring in the ORF1/ORF2 junction region.
Genetic heterogeneity of bovine noroviruses in Italy
Di Martino B;Di Profio F;Di Felice E;Melegari I;Ceci C;Mauroy A;Thiry E;MARTELLA, Vito;Marsilio F.
2014
Abstract
By screening 104 faecal samples from asymptomatic calves in Italy, bovine norovirus RNA was detected with a prevalence rate of 10.5 % (11/104). A continuous sequence spanning the RdRp region and the 5' end of the capsid gene was generated for 7 of the 11 strains. Upon phylogenetic analysis, five strains were grouped with GIII.2 Newbury2-like viruses, and one strain was grouped with GIII.1 Jena-like noroviruses. Interestingly, one strain (80TE/IT) was genetically related to the GIII.1/Jena/80/De in the RdRp but resembled the GIII.2/Newbury2/76/UK in the capsid gene, suggesting a recombination event occurring in the ORF1/ORF2 junction region.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2021-2023 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.