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EnglishGenetic studies of human evolution require high-quality contiguous ape genome assemblies that are not guided by the human reference. We coupled long-read sequence assembly and full-length complementary DNA sequencing with a multiplatform scaffolding approach to produce ab initio chimpanzee and orangutan genome assemblies. By comparing these with two long-read de novo human genome assemblies and a gorilla genome assembly, we characterized lineage-specific and shared great ape genetic variation ranging from single- to mega-base pair-sized variants. We identified ∼17,000 fixed human-specific structural variants identifying genic and putative regulatory changes that have emerged in humans since divergence from nonhuman apes. Interestingly, these variants are enriched near genes that are down-regulated in human compared to chimpanzee cerebral organoids, particularly in cells analogous to radial glial neural progenitors.
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| Titolo: | High-resolution comparative analysis of great ape genomes | |
| Autori: | ||
| Data di pubblicazione: | 2018 | |
| Rivista: | ||
| Handle: | http://hdl.handle.net/11586/227172 | |
| Appare nelle tipologie: | 1.1 Articolo in rivista |
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