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Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is a common lymphoid malignancy with strong heritability. To further understand the genetic susceptibility for CLL and identify common loci associated with risk, we conducted a meta-analysis of four genome-wide association studies (GWAS) composed of 3,100 cases and 7,667 controls with follow-up replication in 1,958 cases and 5,530 controls. Here we report three new loci at 3p24.1 (rs9880772, EOMES, P=2.55x10-11), 6p25.2 (rs73718779, SERPINB6, P=1.97x10-8), and 3q28 (rs9815073, LPP, P=3.62x10-8) as well as a new independent SNP at the known 2q13 locus (rs9308731, BCL2L11, P=1.00x10-11) in the combined analysis. We find suggestive evidence (P<5x10-7) for two additional new loci at 4q24 (rs10028805, BANK1, P=7.19x10-8) and 3p22.2 (rs1274963, CSRNP1, P=2.12x10-7). Pathway analyses of new and known CLL loci consistently show a strong role for apoptosis, providing further evidence for the importance of this biological pathway in CLL susceptibility.
Meta-analysis of Genome-wide Association Studies Discovers Multiple Loci for Chronic Lymphocytic Leukemia.
Berndt Sonja I.;Camp, Nicola J;Skibola, Christine F;Vijai, Joseph;Wang, Zhaoming;Gu, Jian;Nieters, Alexandra;Kelly, Rachel S;Smedby, Karin E;Monnereau, Alain;Cozen, Wendy;Cox, Angela;Wang, Sophia S;Lan, Qing;Teras, Lauren R;Machado, Moara;Yeager, Meredith;Brooks Wilson, Angela R;Hartge, Patricia;Purdue, Mark P;Birmann, Brenda M;Vajdic, Claire M;Cocco, Pierluigi;Zhang, Yawei;Giles, Graham G;Zeleniuch Jacquotte, Anne;Lawrence, Charles;Montalvan, Rebecca;Burdett, Laurie;Hutchinson, Amy;Ye, Yuanqing;Call, Timothy G;Shanafelt, Tait D;Novak, Anne J;Kay, Neil E;Liebow, Mark;Cunningham, Julie M;Allmer, Cristine;Hjalgrim, Henrik;Adami, Hans Olov;Melbye, Mads;Glimelius, Bengt;Chang, Ellen T;Glenn, Martha;Curtin, Karen;Cannon Albright, Lisa A;Ryan Diver, W;Link, Brian K;Weiner, George J;Conde, Lucia;Bracci, Paige M;Riby, Jacques;Arnett, Donna K;Zhi, Degui;Leach, Justin M;Holly, Elizabeth A;Jackson, Rebecca D;Tinker, Lesley F;Benavente, Yolanda;Sala, Núria;Casabonne, Delphine;Becker, Nikolaus;Boffetta, Paolo;Brennan, Paul;Foretova, Lenka;Maynadie, Marc;Mckay, James;Staines, Anthony;Chaffee, Kari G;Achenbach, Sara J;Vachon, Celine M;Goldin, Lynn R;Strom, Sara S;Leis, Jose F;Brice Weinberg, J;Caporaso, Neil E;Norman, Aaron D;Roos, Anneclaire J. De;Morton, Lindsay M;Severson, Richard K;Riboli, Elio;Vineis, Paolo;Kaaks, Rudolph;Masala, Giovanna;Weiderpass, Elisabete;Chirlaque, María Dolores;Vermeulen, Roel C. H;Travis, Ruth C;Southey, Melissa C;Milne, Roger L;Albanes, Demetrius;Virtamo, Jarmo;Weinstein, Stephanie;Clavel, Jacqueline;Zheng, Tongzhang;Holford, Theodore R;Villano, Danylo J;Maria, Ann;Spinelli, John J;Gascoyne, Randy D;Connors, Joseph M;Bertrand, Kimberly A;Giovannucci, Edward;Kraft, Peter;Kricker, Anne;Turner, Jenny;Ennas, Maria Grazia;FERRI, Giovanni Maria;Miligi, Lucia;Liang, Liming;Ma, Baoshan;Huang, Jinyan;Crouch, Simon;Park, Ju Hyun;Chatterjee, Nilanjan;North, Kari E;Snowden, John A;Wright, Josh;Jr, Joseph F. Fraumeni;Offit, Kenneth;Wu, Xifeng;Sanjose, Silvia de;Cerhan, James R;Chanock, Stephen J;Rothman, Nathaniel;Slager, Susan L.
2016-01-01
Abstract
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is a common lymphoid malignancy with strong heritability. To further understand the genetic susceptibility for CLL and identify common loci associated with risk, we conducted a meta-analysis of four genome-wide association studies (GWAS) composed of 3,100 cases and 7,667 controls with follow-up replication in 1,958 cases and 5,530 controls. Here we report three new loci at 3p24.1 (rs9880772, EOMES, P=2.55x10-11), 6p25.2 (rs73718779, SERPINB6, P=1.97x10-8), and 3q28 (rs9815073, LPP, P=3.62x10-8) as well as a new independent SNP at the known 2q13 locus (rs9308731, BCL2L11, P=1.00x10-11) in the combined analysis. We find suggestive evidence (P<5x10-7) for two additional new loci at 4q24 (rs10028805, BANK1, P=7.19x10-8) and 3p22.2 (rs1274963, CSRNP1, P=2.12x10-7). Pathway analyses of new and known CLL loci consistently show a strong role for apoptosis, providing further evidence for the importance of this biological pathway in CLL susceptibility.
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11586/147467
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Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
