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ITSoneDB & ITSoneWB: supporting the metabarcoding investigation of eukaryotic communities 1-gen-2019 Santamaria, Monica; Pesole, Graziano; Fosso, Bruno; Tangaro, MARCO ANTONIO; Flavio Licciulli, Vito; Grillo, Giorgio; Defazio, Giuseppe
Investigating RNA editing in deep transcriptome datasets with REDItools and REDIportal 1-gen-2020 Lo Giudice, C.; Tangaro, M. A.; Pesole, G.; Picardi, E.
Laniakea: an open solution to provide Galaxy "on-demand" instances over heterogeneous cloud infrastructures 1-gen-2020 Tangaro, Marco Antonio; Donvito, Giacinto; Antonacci, Marica; Chiara, Matteo; Mandreoli, Pietro; Pesole, Graziano; Zambelli, Federico
VINYL: Variant prIoritizatioN by survivaL analysis 1-gen-2020 Chiara, Matteo; Mandreoli, Pietro; Tangaro, Marco Antonio; D'Erchia, Anna Maria; Sorrentino, Sandro; Forleo, Cinzia; Horner, David S; Zambelli, Federico; Pesole, Graziano
ELIXIR-IT HPC@CINECA: High performance computing resources for the bioinformatics community 1-gen-2020 Castrignano, T.; Gioiosa, S.; Flati, T.; Cestari, M.; Picardi, E.; Chiara, M.; Fratelli, M.; Amente, S.; Cirilli, M.; Tangaro, M. A.; Chillemi, G.; Pesole, G.; Zambelli, F.
aScan: A Novel Method for the Study of Allele Specific Expression in Single Individuals 1-gen-2021 Zambelli, Federico; Chiara, Matteo; Ferrandi, Erika; Mandreoli, Pietro; Tangaro, Marco Antonio; Pavesi, Giulio; Pesole, Graziano
Laniakea@ReCaS: exploring the potential of customisable Galaxy on-demand instances as a cloud-based service 1-gen-2021 Tangaro, Marco Antonio; Mandreoli, Pietro; Chiara, Matteo; Donvito, Giacinto; Antonacci, Marica; Parisi, Antonio; Bianco, Angelica; Romano, Angelo; Bianchi, Daniela Manila; Cangelosi, Davide; Uva, Paolo; Molineris, Ivan; Nosi, Vladimir; Calogero, Raffaele A; Alessandri, Luca; Pedrini, Elena; Mordenti, Marina; Bonetti, Emanuele; Sangiorgi, Luca; Pesole, Graziano; Zambelli, Federico
CorGAT: a tool for the functional annotation of SARS-CoV-2 genomes 1-gen-2021 Chiara, Matteo; Zambelli, Federico; Tangaro, Marco Antonio; Mandreoli, Pietro; Horner, David S; Pesole, Graziano
REDIportal: millions of novel A-to-I RNA editing events from thousands of RNAseq experiments 1-gen-2021 Mansi, Luigi; Tangaro, Marco Antonio; Lo Giudice, Claudio; Flati, Tiziano; Kopel, Eli; Schaffer, Amos Avraham; Castrignanò, Tiziana; Chillemi, Giovanni; Pesole, Graziano; Picardi, Ernesto
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