D'ERCHIA, ANNA MARIA
D'ERCHIA, ANNA MARIA
DIPARTIMENTO DI BIOSCIENZE , BIOTECNOLOGIE E AMBIENTE
454 GS-Flx Titanium Platform: The Experience of ITB-BA.
2011-01-01 D’Elia, D; Mangiulli, M; Santamaria, M; Paluscio, A; Manzari, C; Caratozzolo, Mf; Marzano, F; Marzano, M; Perlino, E; Fuzio, P; Valletti, A; D'Erchia, ANNA MARIA; Consiglio, A; Gisel, A; Vicario, S; Balech, B; Licciulli, F; Grillo, G; Liuni, S; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Sbisà, E; Tullo, A.
A bioinformatics workflow for the analysis of transcriptome data generated by deep-sequencing.
2010-01-01 Liciulli, F.; Caratozzolo, M. F.; Cornacchia, S.; D'Elia, D.; D'Erchia, ANNA MARIA; Fosso, B.; Grillo, G.; Liuni, S.; Mangiulli, M.; Manzari, C.; Mignone, F.; Paluscio, A.; Picardi, Ernesto; Sbisà, E.; Tullo, A.; Pesole, Graziano
A novel general-purpose RNA-Seq protocol optimizing the detection of transcriptome expression complexity.
2012-01-01 Calabrese, C; Mangiulli, M; Manzari, C; Paluscio, Am; Caratozzolo, Mf; Marzano, F; Kurelac, I; D'Erchia, ANNA MARIA; D’Elia, D; Licciulli, F; Liuni, S; Picardi, Ernesto; Attimonelli, Marcella; Gasparre, G; Porcelli, Am; Pesole, Graziano; Sbisà, E; Tullo, A.
A novel group of IncQ1 plasmids conferring multidrug resistance
2017-01-01 Oliva, Marta; Monno, Rosa; D'Addabbo, Pietro; Pesole, Graziano; Dionisi, A. M; Scrascia, Maria; Chiara, M; Horner, D. S; Manzari, Caterina; Luzzi, I; Calia, Carla; D'Erchia, ANNA MARIA; Pazzani, Carlo
A platform independent RNA-Seq protocol for the detection of transcriptome complexity.
2013-01-01 Calabrese, C; Mangiulli, M; Manzari, C; Paluscio, Am; Caratozzolo, Mf; Marzano, F; Kurelac, I; D'Erchia, ANNA MARIA; D'Elia, D; Licciulli, F; Liuni, S; Picardi, Ernesto; Attimonelli, Marcella; Gasparre, G; Porcelli, Am; Pesole, Graziano; Sbisà, E; Tullo, A.
Accurate detection and quantification of SARS-CoV-2 genomic and subgenomic mRNAs by ddPCR and meta-transcriptomics analysis
2021-01-01 Oranger, A.; Manzari, C.; Chiara, M.; Notario, E.; Fosso, B.; Parisi, A.; Bianco, A.; Iacobellis, M.; D'Avenia, M.; D'Erchia, A. M.; Pesole, G.
Accurate quantification of bacterial abundance in metagenomic DNAs accounting for variable DNA integrity levels
2020-01-01 Manzari, Caterina; Oranger, Annarita; Fosso, Bruno; Piancone, Elisabetta; Pesole, Graziano; D'Erchia, ANNA MARIA
Analysis of adaptation to high concentrations of nickel ions of a novel sphingobium strain by RNA-SEQ
2015-01-01 Ceci, LUIGI RUGGIERO; Volpicella, Mariateresa; Leoni, C; Manzari, C.; Chiara, M.; Picardi, E; Lionetti, C.; Annese, A; D’Erchia, A; Trotta, M; Honer, D; Pesole, G.
Aquatic microbiome diversity under the influence of jellyfish bloom through the application of an Illumina-based protocol
2013-01-01 Manzari, C; Fosso, B; Marzano, M; Annese, A; Intranuovo, M; D'Erchia, ANNA MARIA; Gissi, Carmela; Picardi, Ernesto; Santamaria, M; Caprioli, R; Scorrano, S; Stabili, L; Piraino, S; Pesole, Graziano
ASPicDB: a database of annotated transcript and protein variants generated by alternative splicing
2011-01-01 Martelli, Pl; D'Antonio, M; Bonizzoni, P; Castrignano, T; D'Erchia, ANNA MARIA; De Meo D'Onorio, P; Fariselli, P; Finelli, M; Licciulli, F; Mangiulli, M; Mignone, F; Pavesi, G; Picardi, Ernesto; Rizzi, R; Rossi, I; Valletti, A; Zauli, A; Zambelli, F; Casadio, R; Pesole, Graziano
ASPicDB: a database resource for alternative splicing analysis.
2008-01-01 Castrignano, T; D'Antonio, M; Anselmo, A; Carrabino, D; De Meo, Ad; D'Erchia, ANNA MARIA; Licciulli, F; Mangiulli, M; Mignone, F; Pavesi, G; Picardi, Ernesto; Riva, A; Rizzi, R; Bonizzoni, P; Pesole, Graziano
ASPicDB: A Database Web Tool for Alternative Splicing Analysis.
2015-01-01 D'Antonio, M; Castrignanò, T; Pallocca, M; D'Erchia, ANNA MARIA; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano
BALB/c and C57BL/6 Mice Differ in Polyreactive IgA Abundance, which Impacts the Generation of Antigen-Specific IgA and Microbiota Diversity
2015-01-01 Fransen, Floris; Zagato, Elena; Mazzini, Elisa; Fosso, Bruno; Manzari, Caterina; El Aidy, Sahar; Chiavelli, Andrea; D'Erchia, ANNA MARIA; Sethi, Maya K.; Pabst, Oliver; Marzano, Marinella; Moretti, Silvia; Romani, Luigina; Penna, Giuseppe; Pesole, Graziano; Rescigno, Maria
Characterization of Epstein-Barr virus genotypes in multiple sclerosis by 454 deep sequencing
2012-01-01 Manzari, C; Picardi, Ernesto; Mechelli, R; Policano, C; Umeton, R; Paluscio, Am; D'Erchia, ANNA MARIA; Tullo, A; Ristori, G; Salvetti, M; Pesole, Graziano
Characterization of Epstein-Barr virus genotypes in multiple sclerosis.
2012-01-01 Policano, C; Mechelli, R; Manzari, C; Picardi, Ernesto; Annibali, V; Umeton, R; Coarelli, G; Ricigliano, V; D'Erchia, ANNA MARIA; Tullo, A; Pesole, Graziano; Ristori, G; Salvetti, M.
Characterization of Epstein–Barr virus genotypes in multiple sclerosis through next generation sequencing approaches
2014-01-01 Coarelli, Giulia; Manzari, Caterina; Annese, Anita; Anastasiadou, Eleni; Policano, Claudia; D'Erchia, ANNA MARIA; Picardi, Ernesto; Buscarinu, Maria Chiara; Annibali, Viviana; Ricigliano, Vito Ag; Tullo, Antonia; Trivedi, Pankaj; Pesole, Graziano; Ristori, Giovanni; Salvetti, Marco; Mechelli, Rosella
Characterization of p53 mutations in colorectal liver metastases and correlation with clinical parameters
1999-01-01 A., Tullo; D'Erchia, ANNA MARIA; K., Honda; R. R., Mitry; M. D., Kelly; N. A., Habib; C., Saccone
Comparative Genomics of Listeria Sensu Lato: Genus-Wide Differences in Evolutionary Dynamics and the Progressive Gain of Complex, Potentially Pathogenicity-Related Traits through Lateral Gene Transfer
2015-01-01 Chiara, Matteo; Caruso, Marta; D'Erchia, ANNA MARIA; Manzari, Caterina; Fraccalvieri, Rosa; Goffredo, Elisa; Latorre, Laura; Miccolupo, Angela; Padalino, Iolanda; Santagada, Gianfranco; Chiocco, Doriano; Pesole, Graziano; Horner, David S; Parisi, Antonio
Connecting p63 to cell proliferation: the example of the Adenosine Deaminase target gene
2006-01-01 Sbisa', E.; Mastropasqua, G.; Lefkimmiatis, K.; Caratozzolo, M.; D'Erchia, ANNA MARIA; Tullo, A.
Cumulus Cell Transcriptome after Cumulus-Oocyte Complex Exposure to Nanomolar Cadmium in an In Vitro Animal Model of Prepubertal and Adult Age
2023-01-01 Martino, NICOLA ANTONIO; Picardi, Ernesto; Ciani, Elena; D'Erchia, ANNA MARIA; Bogliolo, Luisa; Ariu, Federica; Mastrorocco, Antonella; Temerario, Letizia; Mansi, Luigi; Palumbo, Valeria; Pesole, Graziano; Dell'Aquila, Maria Elena
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| 454 GS-Flx Titanium Platform: The Experience of ITB-BA. | 1-gen-2011 | D’Elia, D; Mangiulli, M; Santamaria, M; Paluscio, A; Manzari, C; Caratozzolo, Mf; Marzano, F; Marzano, M; Perlino, E; Fuzio, P; Valletti, A; D'Erchia, ANNA MARIA; Consiglio, A; Gisel, A; Vicario, S; Balech, B; Licciulli, F; Grillo, G; Liuni, S; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Sbisà, E; Tullo, A. | |
| A bioinformatics workflow for the analysis of transcriptome data generated by deep-sequencing. | 1-gen-2010 | Liciulli, F.; Caratozzolo, M. F.; Cornacchia, S.; D'Elia, D.; D'Erchia, ANNA MARIA; Fosso, B.; Grillo, G.; Liuni, S.; Mangiulli, M.; Manzari, C.; Mignone, F.; Paluscio, A.; Picardi, Ernesto; Sbisà, E.; Tullo, A.; Pesole, Graziano | |
| A novel general-purpose RNA-Seq protocol optimizing the detection of transcriptome expression complexity. | 1-gen-2012 | Calabrese, C; Mangiulli, M; Manzari, C; Paluscio, Am; Caratozzolo, Mf; Marzano, F; Kurelac, I; D'Erchia, ANNA MARIA; D’Elia, D; Licciulli, F; Liuni, S; Picardi, Ernesto; Attimonelli, Marcella; Gasparre, G; Porcelli, Am; Pesole, Graziano; Sbisà, E; Tullo, A. | |
| A novel group of IncQ1 plasmids conferring multidrug resistance | 1-gen-2017 | Oliva, Marta; Monno, Rosa; D'Addabbo, Pietro; Pesole, Graziano; Dionisi, A. M; Scrascia, Maria; Chiara, M; Horner, D. S; Manzari, Caterina; Luzzi, I; Calia, Carla; D'Erchia, ANNA MARIA; Pazzani, Carlo | |
| A platform independent RNA-Seq protocol for the detection of transcriptome complexity. | 1-gen-2013 | Calabrese, C; Mangiulli, M; Manzari, C; Paluscio, Am; Caratozzolo, Mf; Marzano, F; Kurelac, I; D'Erchia, ANNA MARIA; D'Elia, D; Licciulli, F; Liuni, S; Picardi, Ernesto; Attimonelli, Marcella; Gasparre, G; Porcelli, Am; Pesole, Graziano; Sbisà, E; Tullo, A. | |
| Accurate detection and quantification of SARS-CoV-2 genomic and subgenomic mRNAs by ddPCR and meta-transcriptomics analysis | 1-gen-2021 | Oranger, A.; Manzari, C.; Chiara, M.; Notario, E.; Fosso, B.; Parisi, A.; Bianco, A.; Iacobellis, M.; D'Avenia, M.; D'Erchia, A. M.; Pesole, G. | |
| Accurate quantification of bacterial abundance in metagenomic DNAs accounting for variable DNA integrity levels | 1-gen-2020 | Manzari, Caterina; Oranger, Annarita; Fosso, Bruno; Piancone, Elisabetta; Pesole, Graziano; D'Erchia, ANNA MARIA | |
| Analysis of adaptation to high concentrations of nickel ions of a novel sphingobium strain by RNA-SEQ | 1-gen-2015 | Ceci, LUIGI RUGGIERO; Volpicella, Mariateresa; Leoni, C; Manzari, C.; Chiara, M.; Picardi, E; Lionetti, C.; Annese, A; D’Erchia, A; Trotta, M; Honer, D; Pesole, G. | |
| Aquatic microbiome diversity under the influence of jellyfish bloom through the application of an Illumina-based protocol | 1-gen-2013 | Manzari, C; Fosso, B; Marzano, M; Annese, A; Intranuovo, M; D'Erchia, ANNA MARIA; Gissi, Carmela; Picardi, Ernesto; Santamaria, M; Caprioli, R; Scorrano, S; Stabili, L; Piraino, S; Pesole, Graziano | |
| ASPicDB: a database of annotated transcript and protein variants generated by alternative splicing | 1-gen-2011 | Martelli, Pl; D'Antonio, M; Bonizzoni, P; Castrignano, T; D'Erchia, ANNA MARIA; De Meo D'Onorio, P; Fariselli, P; Finelli, M; Licciulli, F; Mangiulli, M; Mignone, F; Pavesi, G; Picardi, Ernesto; Rizzi, R; Rossi, I; Valletti, A; Zauli, A; Zambelli, F; Casadio, R; Pesole, Graziano | |
| ASPicDB: a database resource for alternative splicing analysis. | 1-gen-2008 | Castrignano, T; D'Antonio, M; Anselmo, A; Carrabino, D; De Meo, Ad; D'Erchia, ANNA MARIA; Licciulli, F; Mangiulli, M; Mignone, F; Pavesi, G; Picardi, Ernesto; Riva, A; Rizzi, R; Bonizzoni, P; Pesole, Graziano | |
| ASPicDB: A Database Web Tool for Alternative Splicing Analysis. | 1-gen-2015 | D'Antonio, M; Castrignanò, T; Pallocca, M; D'Erchia, ANNA MARIA; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano | |
| BALB/c and C57BL/6 Mice Differ in Polyreactive IgA Abundance, which Impacts the Generation of Antigen-Specific IgA and Microbiota Diversity | 1-gen-2015 | Fransen, Floris; Zagato, Elena; Mazzini, Elisa; Fosso, Bruno; Manzari, Caterina; El Aidy, Sahar; Chiavelli, Andrea; D'Erchia, ANNA MARIA; Sethi, Maya K.; Pabst, Oliver; Marzano, Marinella; Moretti, Silvia; Romani, Luigina; Penna, Giuseppe; Pesole, Graziano; Rescigno, Maria | |
| Characterization of Epstein-Barr virus genotypes in multiple sclerosis by 454 deep sequencing | 1-gen-2012 | Manzari, C; Picardi, Ernesto; Mechelli, R; Policano, C; Umeton, R; Paluscio, Am; D'Erchia, ANNA MARIA; Tullo, A; Ristori, G; Salvetti, M; Pesole, Graziano | |
| Characterization of Epstein-Barr virus genotypes in multiple sclerosis. | 1-gen-2012 | Policano, C; Mechelli, R; Manzari, C; Picardi, Ernesto; Annibali, V; Umeton, R; Coarelli, G; Ricigliano, V; D'Erchia, ANNA MARIA; Tullo, A; Pesole, Graziano; Ristori, G; Salvetti, M. | |
| Characterization of Epstein–Barr virus genotypes in multiple sclerosis through next generation sequencing approaches | 1-gen-2014 | Coarelli, Giulia; Manzari, Caterina; Annese, Anita; Anastasiadou, Eleni; Policano, Claudia; D'Erchia, ANNA MARIA; Picardi, Ernesto; Buscarinu, Maria Chiara; Annibali, Viviana; Ricigliano, Vito Ag; Tullo, Antonia; Trivedi, Pankaj; Pesole, Graziano; Ristori, Giovanni; Salvetti, Marco; Mechelli, Rosella | |
| Characterization of p53 mutations in colorectal liver metastases and correlation with clinical parameters | 1-gen-1999 | A., Tullo; D'Erchia, ANNA MARIA; K., Honda; R. R., Mitry; M. D., Kelly; N. A., Habib; C., Saccone | |
| Comparative Genomics of Listeria Sensu Lato: Genus-Wide Differences in Evolutionary Dynamics and the Progressive Gain of Complex, Potentially Pathogenicity-Related Traits through Lateral Gene Transfer | 1-gen-2015 | Chiara, Matteo; Caruso, Marta; D'Erchia, ANNA MARIA; Manzari, Caterina; Fraccalvieri, Rosa; Goffredo, Elisa; Latorre, Laura; Miccolupo, Angela; Padalino, Iolanda; Santagada, Gianfranco; Chiocco, Doriano; Pesole, Graziano; Horner, David S; Parisi, Antonio | |
| Connecting p63 to cell proliferation: the example of the Adenosine Deaminase target gene | 1-gen-2006 | Sbisa', E.; Mastropasqua, G.; Lefkimmiatis, K.; Caratozzolo, M.; D'Erchia, ANNA MARIA; Tullo, A. | |
| Cumulus Cell Transcriptome after Cumulus-Oocyte Complex Exposure to Nanomolar Cadmium in an In Vitro Animal Model of Prepubertal and Adult Age | 1-gen-2023 | Martino, NICOLA ANTONIO; Picardi, Ernesto; Ciani, Elena; D'Erchia, ANNA MARIA; Bogliolo, Luisa; Ariu, Federica; Mastrorocco, Antonella; Temerario, Letizia; Mansi, Luigi; Palumbo, Valeria; Pesole, Graziano; Dell'Aquila, Maria Elena |