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REDIportal: a comprehensive database of A-to-I RNA editing events in humans 1-gen-2017 Picardi, Ernesto; D'Erchia, ANNA MARIA; LO GIUDICE, Claudio; Pesole, Graziano
REDIdb 3.0: A comprehensive collection of RNA editing events in plant organellar genomes 1-gen-2018 Lo Giudice, C.; Pesole, G.; Picardi, E.
RNA editing in plants: A comprehensive survey of bioinformatics tools and databases 1-gen-2019 Lo Giudice, C.; Hernandez, I.; Ceci, L. R.; Pesole, G.; Picardi, E.
Quantifying RNA Editing in Deep Transcriptome Datasets 1-gen-2020 Lo Giudice, C.; Silvestris, D. A.; Roth, S. H.; Eisenberg, E.; Pesole, G.; Gallo, A.; Picardi, E.
Investigating RNA editing in deep transcriptome datasets with REDItools and REDIportal 1-gen-2020 Lo Giudice, C.; Tangaro, M. A.; Pesole, G.; Picardi, E.
RNA Editing Detection in HPC Infrastructures 1-gen-2021 Lo Giudice, Claudio; Mansi, Luigi; Flati, Tiziano; Gioiosa, Silvia; Chillemi, Giovanni; Libro, Pietro; Castrignanò, Tiziana; Pesole, Graziano; Picardi, Ernesto
REDIportal: millions of novel A-to-I RNA editing events from thousands of RNAseq experiments 1-gen-2021 Mansi, Luigi; Tangaro, Marco Antonio; Lo Giudice, Claudio; Flati, Tiziano; Kopel, Eli; Schaffer, Amos Avraham; Castrignanò, Tiziana; Chillemi, Giovanni; Pesole, Graziano; Picardi, Ernesto
High-Throughput Sequencing to Detect DNA-RNA Changes 1-gen-2021 Lo Giudice, Claudio; Pesole, Graziano; Picardi, Ernesto
A primer on machine learning techniques for genomic applications 1-gen-2021 Monaco, A.; Pantaleo, E.; Amoroso, N.; Lacalamita, A.; Lo Giudice, C.; Fonzino, A.; Fosso, B.; Picardi, E.; Tangaro, S.; Pesole, G.; Bellotti, R.
Yeast as a Model to Unravel New BRCA2 Functions in Cell Metabolism 1-gen-2022 Costanza, Alessandra; Guaragnella, Nicoletta; Bobba, Antonella; Manzari, Caterina; L'Abbate, Alberto; LO GIUDICE, Claudio; Picardi, Ernesto; D'Erchia, ANNA MARIA; Pesole, Graziano; Giannattasio, Sergio
A Machine Learning Approach to Parkinson's Disease Blood Transcriptomics 1-gen-2022 Pantaleo, Ester; Monaco, Alfonso; Amoroso, Nicola; Lombardi, Angela; Bellantuono, Loredana; Urso, Daniele; Lo Giudice, Claudio; Picardi, Ernesto; Tafuri, Benedetta; Nigro, Salvatore; Pesole, Graziano; Tangaro, Sabina; Logroscino, Giancarlo; Bellotti, Roberto
The ADAR1 editome reveals drivers of editing-specificity for ADAR1-isoforms 1-gen-2023 Kleinova, Renata; Rajendra, Vinod; Leuchtenberger, Alina F; Lo Giudice, Claudio; Vesely, Cornelia; Kapoor, Utkarsh; Tanzer, Andrea; Derdak, Sophia; Picardi, Ernesto; Jantsch, Michael F
Structural and Comparative Analyses of Insects Suggest the Presence of an Ultra-Conserved Regulatory Element of the Genes Encoding Vacuolar-Type ATPase Subunits and Assembly Factors 1-gen-2023 Lovero, Domenica; Porcelli, Damiano; Giordano, Luca; LO GIUDICE, Claudio; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Pignataro, Eugenia; Palazzo, Antonio; Marsano, RENE' MASSIMILIANO
Dysregulation of testis mRNA expression levels in hatchery-produced vs wild greater amberjack Seriola dumerili 1-gen-2023 Lavecchia, Anna; Manzari, Caterina; Pousis, Chrysovalentinos; Mansi, Luigi; Cox, Sharon N; Mylonas, Constantinos C; Zupa, Rosa; Lo Giudice, Claudio; De Virgilio, Caterina; Picardi, Ernesto; Ventriglia, Gianluca; Pesole, Graziano; Corriero, Aldo
Mitochondrial and Nuclear DNA Variants in Amyotrophic Lateral Sclerosis: Enrichment in the Mitochondrial Control Region and Sirtuin Pathway Genes in Spinal Cord Tissue 1-gen-2024 Cox, SHARON NATASHA; LO GIUDICE, Claudio; Lavecchia, Anna; Poeta, Maria Luana; Chiara, Matteo; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano
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